Для диагностики заболевания проводится общее обследование. Врачи анализируют физиологическое и психическое состояние пациента. Назначаются: общий анализ крови с СОЭ; скрининг функции щитовидной железы; определение уровня гомоцистеина и метилмалоновой кислоты; МРТ; электроэнцефалография; компьютерная томография. Эти исследования помогают исключить другие заболевания.

При обследовании могут использоваться и нейрофизиологические методики. При диагностике расстройства анализируется клиническая картина. Для заболевания характерны: Длительное подавленное состояние. Расстройство диагностируется, если человек находится в подавленном состоянии почти каждый день в течение 2 или более лет. У детей и подростков для постановки диагноза настроение должно быть раздражительным не менее года. Отсутствие периодов мании и гипомании. При дистимии не бывает эйфории. Отсутствие других заболеваний. Депрессия диагностируется, если нет гипотириоза, шизофрении, бредовых расстройств, дефицита фолиевой кислоты, болезни Лайма. Отсутствие наркотической зависимости. К появлению симптомов, характерных для дистимии, может привести употребление психоактивных веществ.